WinISO ist wahrscheinlich die einzige ISO-basierte Software, die Nutzern die Freiheit gibt, verschiedene Funktionen mit ihren ISO-Dateien, wie die Konvertierung in andere Bilddateiformate, das Mounten, die Extraktion und das Brennen dieser auf DVD-Rohlinge oder Blu-ray-Discs, durchzuführen.
Anwender können auch bootfähige ISO-Dateien erstellen und sie bearbeiten.